马德里康普顿斯大学的起源可以追溯到七个世纪前，当时卡斯蒂利亚国王桑乔四世（“勇敢者”）在阿尔卡拉德埃纳雷斯（前康普顿）建立了一个研究中心。 1499 年，在红衣主教希门尼斯·德·西斯内罗斯 (Jiménez de Cisneros) 的赞助下，获得了大学地位，并得到了教皇亚历山大六世的教皇诏书的授权。康普顿斯大学于 1836 年永久迁往马德里，是一所隶属于教育科学部和马德里政府管辖的公共机构。